記者 |金淼
編輯 |許悅
更具傳播能力的冠狀病毒變異毒株正在席卷全球,科學家們正爭分奪秒的了解為什么這些變異毒株傳播更快,以及對于**和檢測試劑來講,這些變異會造成哪些影響。
目前來看,英國和南非發(fā)現(xiàn)的新型冠狀病毒變異毒株似乎更易傳播,而**和治療手段對于南非變異毒株可能不太有效。
除了使現(xiàn)有的**和治療手段都面臨有效性的考驗外,新冠變異毒株也可能降低新冠檢測試劑的有效性。
此前世界衛(wèi)生組織對于變異新冠病毒可能使得新冠檢測試劑失效問題表示,變異病毒中出現(xiàn)的69-70del缺失,可能會讓部分使用S基因靶標的檢測試劑受到影響。
刺突狀的S蛋白是新冠病毒最重要的表面膜蛋白,決定新冠病毒的宿主范圍和特異性。
絕大多數(shù)的診斷試劑還未受到影響,在246個FDA授權(quán)的檢測中,有85%的檢測試劑不依賴S基因,而是通過尋找N基因。約翰斯霍普金斯健康安全中心的免疫學家Gigi Kwik Gronvall在接受華爾街日報采訪時表示,大多數(shù)檢測試劑仍然沒有問題,因為這些檢測試劑的靶標并非S基因。
但包括賽默飛世爾生產(chǎn)的少部分試劑產(chǎn)品受到影響。
賽默飛世爾表示,其一款產(chǎn)品在去年9月和10月間收到了來自英國的報告,表明無法找到英國變異毒株。去年12月,該公司又收到來自美國的相同報告。據(jù)此,賽默飛已經(jīng)開發(fā)了更新軟件,幫助實驗室去標記這部分,并且開發(fā)了新的測試產(chǎn)品,能夠識別與關(guān)鍵變異相關(guān)的病毒突變。
世界衛(wèi)生組織曾建議使用針對S基因檢測產(chǎn)品,可同時平行使用針對不同病毒基因的多靶標檢測,以減少對檢測準確性的影響。
許多試劑制造企業(yè)也在通過增加靶標,以使得檢測更加有效,比如賽默飛世爾的TaqPath組合試劑盒則通過搜尋S基因在內(nèi)的三個靶標來實現(xiàn)檢測,而即使其中S靶標因英國變種導致缺失,其他兩個靶標也能夠幫助檢測完成檢測。
鹽湖城奧雅納實驗室臨床微生物學主任 Kimberly Hanson在此前一次媒體溝通中表示,在檢測時,三個靶標中的兩個出結(jié)果,就可以稱之為陽性檢測了。
2月8日,猶他州的ARUP實驗室通過篩選7.7萬份賽默飛世爾的檢測結(jié)果發(fā)現(xiàn)大約有400例檢測中S蛋白項缺失,賽默飛對其中150個樣本進行了全基因組測序,發(fā)現(xiàn)了其中4例系出現(xiàn)了英國新冠變異毒株。
雖然S基因的失效,但是其對于病毒的區(qū)分也有重要意義。
而一旦出現(xiàn)S基因缺失的情況則也會反映病毒的變異及傳播速度,目前基因測序公司Helix正在對加州和佛羅里達州的檢測結(jié)果進行跟蹤,以發(fā)現(xiàn)變異情況。
拜登政府也于本周內(nèi)表示,疾控中心將投資約2億元,擴大病毒基因測序規(guī)模,以追蹤新出現(xiàn)的變異。
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